厭氧流體化床(AnFB)處理技術係藉由反應器內填充細小載體，以提供廣大表面積供厭氧微生物附著及增殖。廢水由反應槽底部進入，由下往上流動，利用快速上升水流使生物膜單體呈流體化狀態，增加基質傳送速率，進而提高生物處理效率。

上流式厭氧污泥床(Upflow anaerobic sludge bed; UASB)係於厭氧的環境下，藉由厭氧微生物將有機物轉化成甲烷及二氧化碳。上流式厭氧污泥床不需要任何機械攪拌，而藉由廢水流經反應槽底部高濃度污泥床及生物反應產生之氣體使污泥膨脹，反應槽頂設置氣固液三相分離區，將氣體收及並排出槽外，而隨氣體上浮之污泥沉降至反應槽底部之污泥床，處理水則排出反應槽，具有低能源消耗、低污泥產量、低占地面積及高體積效率之優點。

純氧曝氣活性污泥法與曝氣活性污泥法基本原理相同，唯將空氣曝氣改為純氧曝氣。由於純氧的濃度比空氣中氧濃度高4.7倍，純氧曝氣可大幅提升氧氣傳輸效率，進而提高微生物濃度與活性，同時縮短曝氣時間、減少廢棄污泥量及良好污泥沉降性。

活性污泥法係指於設置曝氣系統之生物反應器中，好氧微生物利用水中的溶氧，將廢水中的有機物轉化成二氧化碳及水，同時合成新的微生物體。

生物接觸氧化法係將接觸材料固定浸於曝氣槽中，接觸材料表面供微生物附著及增殖以形成生物膜，在好氧的環境下，廢水與接觸材料上之生物膜充分接觸，透過生物降解作用以去除廢水中之有機物質。

批次活性污泥(Sequencing Batch Reactor Activated Sludge, SBR)法與活性污泥法基本原理相似，唯將連續式操作改為批次式操作，按時序以間歇曝氣方式，於同一反應槽中完成進水、反應、沉降、排水及靜置等五個階段。曝氣槽同時兼具調勻及沉澱功能，同時無需設置污泥迴流設備，占地面積小、耗能低、便於操作和維護管理。

薄膜生物反應器(Membrane BioReactor; MBR)係將薄膜處理單元與活性污泥法結合之處理系統，利用沉浸於曝氣槽內之薄膜處理單元截留微生物體，取代傳統生物處理系統之沉澱槽且保持曝氣槽內高活性污泥濃度，減少占地面積，同時達到高品質處理水之目的。

流動床生物膜(Moving Bed Biofilm ;MBBR)係於生物反應系統中投入多孔性懸浮載體，以提供廣大的有效表面積微生物附著及增殖，進而提高單位體積生物污泥量及處理效率。搭配多孔性載體比重與水相近之特性，於曝氣時，載體與廢水完全混合，具有低磨耗、均勻分散氣體及廢水、生物膠羽沉降性佳及處理水質穩定之優點。

生物硝化/脫硝係於好氧的環境下，硝化菌將氨氮轉化成硝酸鹽氮，再於缺氧環境下，脫硝菌利用有機碳源將硝酸鹽氮轉化成氮氣。